Фирмой
Super Array Bioscience
http://www.superarray.com/PCRArrayPlate.php
разработаны основанные на панелях генов удобные системы определения количества ПЦР-продукта в реальном времени - так называемые
RT2 временные PCR Arrays.
Реал-тайм ПЦР арреи – наиболее достоверный инструмент для анализа экспрессии интересующей панели генов. Ячейки плашки, представляющей аррей, содержат наборы праймеров, оптимизированных для использования с SYBR Green красителем. Сама плашка представляет собой тщательно подобранную панель интересующих исследователя генов, участвующих в пути передачи сигнала или заболевании. Высокое качество дизайна праймеров и составления смесей для реакций позволяют амплифицировать с помощью ПЦР арреев до 96 (384) различных ген-специфичных продуктов одновременно при одинаковых условиях амплификации.
Приведенные системы панелей генов имеют следующие преимущества:
- Количественная ПЦР в реальном времени с использованием в качестве флуоресцентного красителя SYBR Green
- Одновременный анализ экспрессии многих генов (96, 384)
- Наличие ряда готовых панелей генов для анализа различных путей передачи сигнала
- Использование различных housekeepings в одной панели
- Возможность заказа набора для анализа отдельных генов исследуемой панели
- Широкий выбор амплификаторов разных фирм для работы с арреями
Данная система имеет также и ряд недостаков:
- Относительная дороговизна аррея (хотя если сравнивать с отдельным заказом для каждого гена - получается дешевле)
- Время доставки увеличено (везут из-за рубежа, недели три)
- Ограниченная видоспецифичность подобранных путей передачи сигнала на настоящий момент.
К сожалению, далеко не каждый из разработанных компанией Super Array арреев путей передачи сигнала или заболевания рассчитан на работу с кДНК крысы (а мы, к примеру, на крысах работаем). В основном все разработанные арреи рассчитаны на человека и мышь. Арреев для работой с кДНК крыс мало.
Надеюсь, эта информация окажется для Вас полезной
